随着微生物纯培养技术、现代生物技术的发展而逐渐形成了现代微生物转化中药技术，其特点是采用优选的微生物或其代谢产物进行中药转化，通过对转化产物进行药效、药理、*理等方面的系统分析与评价，从而获得更有价值的功能性产物或药物先导化合物，实现转化产物的产业化开发。
微生物的增殖比较快，且初级代谢迅速、体内酶系丰富。整个微生物转化过程可实现自动化、连续化。与化学反应相比，微生物转化具有高度的立体结构选择性、转化效率高、安全无*、节能减排、设备简单、成本较低等优点，且微生物种类繁多，在生长过程中产生 酶、木质素酶、淀粉酶等多种多样的酶系，能够催化一些化学合成难以进行的反应。此外，微生物转化通常是在室温、中性环境进行的生化反应，故能有效地保护中药挥发油等热敏性活性成分免遭破坏。
1微生物转化中药的研究方式
根据研究者所采用的微生物或其代谢产物的类别不同，可分为以下几种方式：
1.1利用微生物代谢物（酶体系）对中药成分转化
1.1.1利用外来酶的作用
酶对于中药的研制起到了举足轻重的作用，将适度、适量、种类合适的酶同药用成分一同反应，利用酶对某些化学反应的催化作用，可以大大提高中药制作的速度和生产药品的质量。生物学家们将发酵技术与酶提取技术相结合，从微生物细胞中快速提取出细胞中的各种酶，然后，有选择的利用于成分转化，这些技术目前应用越来越广泛，其在中药研制中主要用来获取单一的有效成分。
1.1.2利用中草药植物本身含有的自身酶作用
在中药加工过程中发挥自身酶的作用，制备高活性有效成分含量高的中药或者提取物——活性中药。也就是说，中药加工过程中，有目的地发挥自身酶作用，提高有效活性成分的含量，改变了传统的中药加工的炮制和煎制等加工方法。如人参植物中含有人参皂苷酶。在红参加工过程中激活其自身皂苷酶，制备活性红参；其活性红参中的稀有皂苷Rg2、Rg3、Rg4、Rg5、Rh1、Rh2、Rh3、Rh4含量比传统红参提高十几倍。其实，在传统中药炮制过程中，也存在运用自身酶的例子，例如一些种子类中药发芽炮制，就运用了自身酶的转化作用，如大豆*卷、麦芽、谷芽等。
1.2利用真菌微生物体系对中药成分转化
由于真菌在微生物中具有种类多、次生代谢产物多、培养条件比较简单等特点，已被广泛使用并深入研究，其药用价值和生产方面也不断得以提高。同时由于真菌具有分解 、淀粉、蛋白质、脂类等营养物质的强大分解能力和合成能力来转化中药中的某些成分，提高发酵中药的药效，甚至生成新的活性成分。
1.3利用细菌微生物体系对中药成分转化
由于细菌较真菌有更快的生长繁殖速度，筛选有较强综合转化能力的细菌的工作也日益受到广泛的